Hva er en ubikineringsinhibitor analysen?

April 3  by Eliza

Ubikineringsinhibitor refererer til binding av proteinet ubiquitin til andre proteiner med tre forskjellige enzymer. En ubikineringsinhibitor analysen er en test som bestemmer hvor mye av denne prosessen skjer i cellen. Tester kan brukes til å bestemme hvordan ulike forhold påvirker proteinbinding, trinn og strukturer som er av betydning i ubiquitinnation veien, og mengden av protein i cellen. Utilstrekkelige eller overabundant beløp har vært knyttet til utvikling av mange forskjellige sykdommer.

Et protein som finnes i cellene, funksjonen av ubiquitin er å bindes til proteiner samtidig fungerer som et "merke" eller signal til andre strukturer. Denne "tag" så signaliserer enzymer for å vite at proteinet kan bli ødelagt, resirkulert, eller flyttet. Resultatet er ødeleggelsen eller transport av proteiner.

Disse tagging proteiner er viktig for DNA-reparasjon, virusinfeksjoner og immunrespons. Andre viktige funksjoner inkluderer roller i celledød, celledeling og utvikling av celler. For mye ubiquitin, eller mangel derav, kan spille en rolle i dannelsen av mange sykdommer, slik som kreft, genetiske sykdommer og sykdommer i immunsystemet.

Forskere vil bruke en ubikineringsinhibitor assay for å prøve å finne ut hvilke forholdene endre konsentrasjonen av proteinet i cellen, og å sammenligne syke celler med friske celler. Forskere også bruke den til å undersøke hvilke forhold vil føre til en endring i bindende. I tillegg kan de prøver å knytte spesifikk DNA-kode med den mengden av enzymer i cellen.

Det er mer enn en type ubikineringsinhibitor assay som forskere spesielt bruk. Man vil bestemme prosentandelen av proteinene som er bundet med ubiquintin. En annen undersøker aktiviteten av enzymer eller tilstedeværelse av andre mellomprodukter som finnes i ubiquination pathway. Ulike analyser er utviklet på grunnlag av målproteinet som ubiquitin vil binde seg til.

Grunnlaget for en ubikineringsinhibitor analysen er å inkorporere en forbindelse som er merket ved hjelp av en annen lett målt kjemisk. I onkologi assays, kan ubiquitin merkes med kryptat, en forbindelse som inneholder to nitrogenatomer. Dette kan brukes til å bestemme hvilket enzym som er mest aktive i cellen.

En ubikineringsinhibitor analysen vil ha to trinn. Den første er en enzymatisk trinn hvor enzymer vil binde det merkede ubiquitin til målproteinet. Det andre er et deteksjonstrinn hvor bindingen av målproteinet er undersøkt ved hjelp av et konjugat slik som et antistoff. Antistoffet vil fluorescere, eller endre farge, som deretter tillater forskeren til å bestemme aktiviteten av enzymene.