Hva Er Peptide Binding?

December 12  by Eliza

Peptid bindingen er en amidbinding mellom polypeptid og proteinmolekyler i aminosyrer, også kjent som en peptid-kjede. En kovalent binding er karakteristisk for peptid-binding og er viktig for normal peptidsyntese. Med andre ord, peptidbindinger koble aminosyrene i en bestemt rekkefølge som skaper protein polymerer og styrer dannelsen av unike og tredimensjonale (3D-strukturer. Uten peptid binding, viktige reaksjoner som omfatter aminosyrer blir hemmet.

I form av molekylær kjemi, kobling av to eller flere aminosyrer som danner en peptid-molekyl. Peptidbindingen former hvor en karboksylsyre molekyl reagerer med en aminogruppe i den neste aminosyre molekyl. Den resulterende molekyl er en dipeptide - to aminosyrer bundet sammen av peptid binding. Peptidbindinger er unike for amino gruppen de er linket til.

Prosessen med peptidsyntese, eller proteinsyntesen, involverer dannelsen av et peptid-kjeden, og en serie av biokjemiske reaksjoner med forskjellige typer av ribonukleinsyre (RNA) molekyler - meddeler, ribosomalt og overførings RNA - og aminosyrer. Proteinsyntesen foregår som ribosomet settes det messenger-RNA (mRNA), og en peptidbinding dannes mellom to aminosyremolekyler følgende oversettelse. Hver gang peptid binding oppstår, en ny aminosyre blir tilsatt til det som kalles en polypeptidkjede. Under visse omstendigheter kan flere ribosomer sette den samme tråd av mRNA, noe som resulterer i dupliserende peptid-binding og således duplisere peptidkjeder.

Når proteinsyntesen er fullført, blir polypeptidkjeden frigjøres ved en enzym-katalysert reaksjon og danner en 3D-struktur som blir et biologisk aktivt protein. Effektiviteten av noen antibiotika som brukes for behandling av bakterielle infeksjoner er basert på peptid-binding under proteinsyntese. Ved å interferere med dannelsen av proteiner som kreves av bakterier, kan antibiotika stoppe bakterier formerer seg.

Antibiotika som hemmer peptid binding også hemme proteinsyntese. Mange antibiotika kan ikke målrette usunn celler spesifikt, slik at de ender opp som påvirker friske celler i løpet av prosessen, selv om det er noen medikamenter som virker bare på bakterieceller ved å målrette bakterier ribosomer. Virkningsmekanismen for antibiotika kan forhindre transkripsjon av RNA eller veksten av peptidkjeder ved peptid bindingsdannelse inhibering. Andre mekanismer er ufullstendige protein koding og forhindring av transkripsjon RNA (tRNA), som alle er avhengige av biokjemiske-mediert peptid-binding.

Et behov for peptidsyntesen selskaper dukket opp som et resultat av etterspørsel fra forsknings- og utviklingsteam belastet med ny antibiotika utvikling. I behovs peptid inkluderer tilpasset sekvensering med massespektrometri, eller utviklingen av et peptid katalog eller peptid-bibliotek. Noen av disse tjenesteleverandørene leverer også modifiserte peptider og syntese materialer.