Hva er RNA analyse?

March 10  by Eliza

RNA-analyse er en vidt begrep henviser til hvilken som helst av en rekke teknikker som er involvert i å samle inn data om en sekvens av ribonukleinsyre (RNA). Deoksyribonukleinsyre (DNA) inneholder de genetiske instruksjoner som styrer nesten alle aspekter av utseende og virkemåten av de forskjellige deler av en organisme. Deler av DNA som blir transkribert til RNA, og trådene av RNA blir deretter omregnet til proteiner, eller funksjonelle kjemiske enheter som er direkte eller indirekte er viktig for de fleste av de kjemiske og strukturelle aspekter av organismer. Noen former for RNA er ikke oversatt til proteiner, men er i stedet funksjonell grunn av sine egne kjemiske egenskaper. RNA-analyse er vanligvis beregnet på å lese den genetiske koden inneholdt i et gitt RNA-tråden, men den kan også være ment å avdekke andre strukturelle eller funksjonelle egenskaper.

En av de mest vanlige og grunnleggende typer RNA analyse er sekvensanalyse. RNA består av fire typer av molekyler som kalles nukleotider: adenin, guanin, cytosin og uracil. Bestemmelse av sekvensen av nukleotider i slike kjeder av RNA tillater forskere å forutsi strukturen til en resulterende protein, eller for å lete etter mutasjoner i sekvensen. Sekvensanalyse kan også brukes for å forutsi strukturen til RNA-kjeder som er funksjonell på egen hånd og ikke er oversatt til proteiner.

En annen relativt vanlig form for RNA-analyse er strukturanalyse, som er rettet mot å bestemme den sekundære struktur av et gitt RNA-kjede. Funksjonene til RNA-kjeder som ikke er oversatt til proteiner komme ut av sine tre-dimensjonale strukturer, som vanligvis refereres til som sekundære strukturer. Forstå den sekundære struktur av et RNA kjeden gjennom strukturelle RNA-analyse kan hjelpe forskerne bedre forstå mekanismene gjennom hvilke RNA kjeden funksjoner. Strukturell RNA-analyse kan gjennomføres gjennom datastyrt forutsigelser basert på RNA sekvensering og gjennom ulike eksperimentelle metoder.

RNA kan ha ulike funksjoner utover koding for proteiner eller serverer begrensede funksjoner i en organisme. Noen av disse funksjonene er tydelig i visse typer virus som har RNA genomer, noe som betyr at alle deres genetiske informasjonen er lagret som RNA. Slike virus invadere vertsceller og replikeres ved hjelp av proteiner som kan utvikles fra RNA-genom. Andre typer virus bruker en prosess som kalles revers transkripsjon å lage DNA fra RNA. RNA analyse kan tillate forskere til å bestemme, i en grad, hvor disse virusene fungere og å tenke ut mulige måter å nøytralisere dem.